phpで処理中表示

PHP
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pplog2にて、どうしてもテンプレートの適用作業の際に時間がかかるので
処理中をpopupで出したいのですが、、、うまくいかない。。。
ポストする際にonClickで開いた窓はスクリプトがreloadされるためか、
終わったあとに閉じられないし、、、んー困った。
処理の開始で窓を開くように指定してもなんだか処理が終わる頃に開いて意味がないし、、
どうすりゃいいんだろ。。。

かなり困ってます。

まぁ一番の策は諦めるですが、、、

うまくいったら公開したい機能の一つなんです。。

なにか良い知恵ないですかね。。。